虽和五阿哥永琪（古巨基 饰）最终结为连理，但是小燕子（黄奕 饰）丝毫不改调皮顽劣的本性，伙同永琪、尔康（周杰 饰）、紫薇（马伊俐 饰）又惹出不少乱子，更时不时假传圣旨安排晴儿（王艳 饰）和萧剑（黄晓明 饰）见面。在此过程中，小燕子渐渐弄清了自己的身世，由此对永琪和一向亲近的皇阿玛产生了矛盾复杂的情怀。皇太后担心永琪的子嗣问题…

西天取经五百年后，如来圆寂，金翅大鹏祸乱三界。孙悟空为拯救三界，口含如来舍利降世人间。在召集师弟沙悟净、朱悟能的过程中，悟空终于领悟舍身取义的无量佛法，蜕变真身，消灭蛤蟆精，踏上打败金翅大鹏的西行路。